Centrom upravlja Upravno vijeće.
Upravno vijeće čine tri predstavnika osnivača, jedan predstavnik radnika zaposlen u Centru i jedan predstavnik korisnika Centra ili njegov roditelj ili skrbnik.
Centar zastupa i predstavlja ravnatelj.
Računovodstveni i administrativni poslovi u Centru obavljaju se pod neposrednim rukovođenjem ravnatelja.
Rad Centra ustrojen je kroz odjele
Između radnika odjela ravnatelj imenuje voditelje.